Egy nukleotidsor hármas csoportokra bontása előtt meg kell adni, honnan induljon az olvasás. Ugyanaz a betűsor más kezdőpontból más tripleteket ad. Az olvasási keret ezért a fordítás lényegi bemenete, és egy rövid szekvenciából nem mindig dönthető el önmagában.
Három lehetséges kezdőpont
Vegyük az 5′-ATGGAACTGTAA-3′ DNS-sorozatot kódoló szálként, a standard genetikai kódot feltételezve. Az első bázistól ATG–GAA–CTG–TAA csoportok adódnak. RNS-átírásban U kerül T helyére: AUG–GAA–CUG–UAA. Ez Met–Glu–Leu–STOP leírást ad a tanpéldában.
A második bázistól TGG–AAC–TGT és két megmaradó betű olvasható. A harmadiktól GGA–ACT–GTA és egy maradék betű. A maradék egy vagy két nukleotid nem alkot teljes kodont; az eszköznek ezt külön kell kezelnie.
Melyik szálat fordítjuk?
Az előző példában kifejezetten kódoló DNS-szálat adtunk meg. Templátszálnál a komplementer kapcsolatot és az irányt is rendezni kell, mielőtt RNS-kodonokra bontunk. Az ismeretlen eredetű betűsor egyszerű T→U cseréje ezért nem minden esetben elegendő.
A stopkodon a standard kódban a fordítás lezárását jelzi, nem egy újabb aminosavat. A program beállításától függően a megjelenítés megállhat az első stopnál, vagy jelölheti a további kodonokat is. Ezt az eredmény olvasásakor ellenőrizd.
A betűsor és a biológiai jelentés
Egy lehetséges aminosavsor kiszámítása nem bizonyítja, hogy a szekvencia valóban fehérjét kódol, vagy hogy a választott keret a biológiailag használt. Eltérő genetikai kódtáblák is léteznek. A kalkulátorban dokumentáld a száltípust, az irányt, az olvasási keretet és a kódtáblát. Így a kapott sorozat megismételhető számítás eredménye marad.
Kapcsolódó DG Kalkulátor megnyitása
Forrás és módszertani háttér
A számpéldák saját szemléltető számítások.
Saját, végigvezetett számítási példa; a képlet és a modell feltételei a szövegben szerepelnek.
Háromkérdéses tudáspróba
Minden kérdésnél egy választ jelölj meg. A kiértékelés a cikk megértését ellenőrzi.
1. Hány teljes kodon fér 11 nukleotidba az elsőtől kezdve?
- A) 4
- B) 3
- C) 11
2. A kódoló DNS T betűje az RNS-ben mire cserélődik?
- A) A-ra
- B) C-re
- C) U-ra
3. Mit bizonyít egy számolt aminosavsor?
- A) A választott keret és kódtábla szerinti fordítást
- B) Biztos génazonosságot
- C) Biztos fehérjefunkciót
Megoldások és önálló pontozás
Minden helyes válasz 1 pont. 3 pont: a három összefüggést helyesen alkalmaztad; 2 pont: nézd át a téves válaszhoz tartozó részt; 0–1 pont: számold végig újra a példát. A rövid próba kizárólag e cikk tanulságaira vonatkozik.
1. Hány teljes kodon fér 11 nukleotidba az elsőtől kezdve?
B) 3 – Három triplet és két maradék nukleotid adódik.
2. A kódoló DNS T betűje az RNS-ben mire cserélődik?
C) U-ra – A kódoló szálhoz viszonyítva az RNS-ben uracil szerepel timin helyett.
3. Mit bizonyít egy számolt aminosavsor?
A) A választott keret és kódtábla szerinti fordítást – A biológiai funkció megállapításához további bizonyíték kell.